Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TMEM175Q9BSA9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM175Q9BSA9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM175Q9BSA9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM175Q9BSA9 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM175Q9BSA9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM175Q9BSA9 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM175Q9BSA9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM175Q9BSA9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMEM175Q9BSA9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM175Q9BSA9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM175Q9BSA9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM175Q9BSA9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM175Q9BSA9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM175Q9BSA9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM175Q9BSA9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM175Q9BSA9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM175Q9BSA9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM175Q9BSA9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM175Q9BSA9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM175Q9BSA9 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM175Q9BSA9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMEM175Q9BSA9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms