Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK5

SDF4, 45 kDa calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDF4Q9BRK5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDF4Q9BRK5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDF4Q9BRK5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms