Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRA2

TXNDC17, Thioredoxin domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC17Q9BRA2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TXNDC17Q9BRA2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TXNDC17Q9BRA2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms