Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TCF25Q9BQ70 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCF25Q9BQ70 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 693.8 ms