Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
HOPXQ9BPY8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HOPXQ9BPY8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms