Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CITED2Q99967 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms