Protein–RNA interactions for Protein: Q99758

ABCA3, ATP-binding cassette sub-family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA3Q99758 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ABCA3Q99758 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ABCA3Q99758 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ABCA3Q99758 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms