Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MEIS3Q99687 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
MEIS3Q99687 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MEIS3Q99687 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms