Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RGPD5Q99666 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RGPD5Q99666 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms