Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
EIF3CQ99613 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EIF3CQ99613 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms