Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NUP88Q99567 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NUP88Q99567 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms