Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UIMC1Q96RL1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UIMC1Q96RL1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms