Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACCSQ96QU6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACCSQ96QU6 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms