Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
GCNAQ96QF7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GCNAQ96QF7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms