Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRNT1Q96Q11 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRNT1Q96Q11 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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