Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR6

CFAP57, Cilia- and flagella-associated protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP57Q96MR6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CFAP57Q96MR6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP57Q96MR6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms