Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NSMCE3Q96MG7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NSMCE3Q96MG7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms