Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM227BQ96M60 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM227BQ96M60 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms