Protein–RNA interactions for Protein: Q96LP6

C12orf42, Uncharacterized protein C12orf42, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf42Q96LP6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C12orf42Q96LP6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
C12orf42Q96LP6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
C12orf42Q96LP6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
C12orf42Q96LP6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C12orf42Q96LP6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms