Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C8orf48Q96LL4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C8orf48Q96LL4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C8orf48Q96LL4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms