Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDHR1Q96JP9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CDHR1Q96JP9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms