Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHDQ96IW2 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHDQ96IW2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms