Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 AC115837.2-201ENST00000522127 677 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
MS4A3Q96HJ5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A3Q96HJ5 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A3Q96HJ5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A3Q96HJ5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A3Q96HJ5 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A3Q96HJ5 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A3Q96HJ5 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A3Q96HJ5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A3Q96HJ5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A3Q96HJ5 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A3Q96HJ5 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A3Q96HJ5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A3Q96HJ5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A3Q96HJ5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A3Q96HJ5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A3Q96HJ5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
MS4A3Q96HJ5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A3Q96HJ5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A3Q96HJ5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A3Q96HJ5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A3Q96HJ5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A3Q96HJ5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A3Q96HJ5 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A3Q96HJ5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A3Q96HJ5 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A3Q96HJ5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A3Q96HJ5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A3Q96HJ5 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms