Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NEIL1Q96FI4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NEIL1Q96FI4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEIL1Q96FI4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEIL1Q96FI4 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEIL1Q96FI4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEIL1Q96FI4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEIL1Q96FI4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEIL1Q96FI4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEIL1Q96FI4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEIL1Q96FI4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEIL1Q96FI4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NEIL1Q96FI4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms