Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC10A4Q96EP9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC10A4Q96EP9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms