Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RTP4Q96DX8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RTP4Q96DX8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms