Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATG4CQ96DT6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ATG4CQ96DT6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms