Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGBD4Q96DM1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PGBD4Q96DM1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms