Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT2

KLHL29, Kelch-like protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL29Q96CT2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLHL29Q96CT2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLHL29Q96CT2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms