Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSUN4Q96CB9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSUN4Q96CB9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSUN4Q96CB9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms