Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SPTSSAQ969W0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms