Protein–RNA interactions for Protein: Q969P6

TOP1MT, DNA topoisomerase I, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1MTQ969P6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TOP1MTQ969P6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TOP1MTQ969P6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms