Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KIFAP3Q92845 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KIFAP3Q92845 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms