Protein–RNA interactions for Protein: Q92537

SUSD6, Sushi domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD6Q92537 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD6Q92537 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD6Q92537 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD6Q92537 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUSD6Q92537 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD6Q92537 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD6Q92537 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD6Q92537 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD6Q92537 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD6Q92537 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD6Q92537 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD6Q92537 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD6Q92537 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD6Q92537 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD6Q92537 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD6Q92537 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUSD6Q92537 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SUSD6Q92537 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SUSD6Q92537 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms