Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SCG3Q8WXD2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SCG3Q8WXD2 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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