Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PALLDQ8WX93 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PALLDQ8WX93 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PALLDQ8WX93 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PALLDQ8WX93 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PALLDQ8WX93 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PALLDQ8WX93 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PALLDQ8WX93 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PALLDQ8WX93 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms