Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FNDC9Q8TBE3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FNDC9Q8TBE3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.4 ms