Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MCPH1Q8NEM0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MCPH1Q8NEM0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCPH1Q8NEM0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCPH1Q8NEM0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCPH1Q8NEM0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCPH1Q8NEM0 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCPH1Q8NEM0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCPH1Q8NEM0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCPH1Q8NEM0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCPH1Q8NEM0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCPH1Q8NEM0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCPH1Q8NEM0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCPH1Q8NEM0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCPH1Q8NEM0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCPH1Q8NEM0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCPH1Q8NEM0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MCPH1Q8NEM0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCPH1Q8NEM0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCPH1Q8NEM0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCPH1Q8NEM0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCPH1Q8NEM0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCPH1Q8NEM0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCPH1Q8NEM0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MCPH1Q8NEM0 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms