Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM35BQ8NCS4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM35BQ8NCS4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms