Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HJURPQ8NCD3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HJURPQ8NCD3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms