Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATG16L2Q8NAA4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATG16L2Q8NAA4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms