Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC63Q8NA47 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC63Q8NA47 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms