Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL34Q8N239 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL34Q8N239 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL34Q8N239 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL34Q8N239 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL34Q8N239 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL34Q8N239 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL34Q8N239 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL34Q8N239 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL34Q8N239 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL34Q8N239 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL34Q8N239 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL34Q8N239 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL34Q8N239 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL34Q8N239 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
KLHL34Q8N239 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL34Q8N239 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL34Q8N239 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL34Q8N239 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL34Q8N239 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL34Q8N239 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL34Q8N239 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL34Q8N239 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL34Q8N239 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL34Q8N239 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL34Q8N239 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL34Q8N239 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
KLHL34Q8N239 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
KLHL34Q8N239 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL34Q8N239 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
KLHL34Q8N239 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms