Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00518Q8N0U6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00518Q8N0U6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms