Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SYCP3Q8IZU3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SYCP3Q8IZU3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms