Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYM2

SLFN12, Schlafen family member 12, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN12Q8IYM2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLFN12Q8IYM2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLFN12Q8IYM2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLFN12Q8IYM2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN12Q8IYM2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN12Q8IYM2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN12Q8IYM2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN12Q8IYM2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN12Q8IYM2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN12Q8IYM2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN12Q8IYM2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN12Q8IYM2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN12Q8IYM2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN12Q8IYM2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN12Q8IYM2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLFN12Q8IYM2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN12Q8IYM2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN12Q8IYM2 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN12Q8IYM2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN12Q8IYM2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN12Q8IYM2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN12Q8IYM2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN12Q8IYM2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN12Q8IYM2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLFN12Q8IYM2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN12Q8IYM2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms