Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXI1

RHOT2, Mitochondrial Rho GTPase 2, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOT2Q8IXI1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RHOT2Q8IXI1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms