Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWQ3

BRSK2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK2Q8IWQ3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRSK2Q8IWQ3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRSK2Q8IWQ3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRSK2Q8IWQ3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRSK2Q8IWQ3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRSK2Q8IWQ3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRSK2Q8IWQ3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BRSK2Q8IWQ3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BRSK2Q8IWQ3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRSK2Q8IWQ3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRSK2Q8IWQ3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRSK2Q8IWQ3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRSK2Q8IWQ3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRSK2Q8IWQ3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRSK2Q8IWQ3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRSK2Q8IWQ3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRSK2Q8IWQ3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRSK2Q8IWQ3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRSK2Q8IWQ3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRSK2Q8IWQ3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRSK2Q8IWQ3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRSK2Q8IWQ3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRSK2Q8IWQ3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRSK2Q8IWQ3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRSK2Q8IWQ3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BRSK2Q8IWQ3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BRSK2Q8IWQ3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRSK2Q8IWQ3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BRSK2Q8IWQ3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms