Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUX4

APOBEC3F, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3FQ8IUX4 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APOBEC3FQ8IUX4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOBEC3FQ8IUX4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms