Protein–RNA interactions for Protein: Q86V59

PNMA8A, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8AQ86V59 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PNMA8AQ86V59 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA8AQ86V59 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA8AQ86V59 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA8AQ86V59 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA8AQ86V59 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA8AQ86V59 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA8AQ86V59 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA8AQ86V59 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA8AQ86V59 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA8AQ86V59 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PNMA8AQ86V59 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA8AQ86V59 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA8AQ86V59 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA8AQ86V59 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA8AQ86V59 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA8AQ86V59 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA8AQ86V59 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA8AQ86V59 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA8AQ86V59 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA8AQ86V59 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA8AQ86V59 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA8AQ86V59 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA8AQ86V59 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA8AQ86V59 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNMA8AQ86V59 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PNMA8AQ86V59 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
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